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ベンチマーク2日目!HPLコンパイルをやってみる!

2008年06月04日 14:44

残念なことに、昨日の時点ではmakeしたのにmake installをしてないという意味不明なことをやっていたらしい。あほですね。

とりあえずは先輩のところにいっていろいろ聞いてみた。お世話になりました。
どうやらいろいろ準備が足りなかったらしい。ほとんど聞いてばっかりでした。

んで教えてもらった参考ページをみて出直すことに。。。

かなり詳しく書いてていいサイトってことで参考にしました。英語じゃないだけで嬉しいのは重症だと思います。




教えてもらったのはこのページ。
わりと親切です。でもベンチマークなんてそうそうできませんよねー。ですよねー。

http://mikilab.doshisha.ac.jp/dia/research/report/2005/0702/001/report20050702001.html

さて、ATLASのインストールですが

make install arch=~でできます。
で、現在やってますがかなり長いです。
同じ作業を延々と繰り返している感じ。最適な何かを探しているらしいのですが終わらないと帰れません。
クラスタ側だからそうでもないのかな。。。でも端末切ったらどうなるかわからないし。

さて、ログ日記らしく今日もログを残します。

#
# -- High Performance Computing Linpack Benchmark (HPL)
# HPL - 1.0a - January 20, 2004
# Antoine P. Petitet
# University of Tennessee, Knoxville
# Innovative Computing Laboratories
# (C) Copyright 2000-2004 All Rights Reserved
#
# -- Copyright notice and Licensing terms:
#
# Redistribution and use in source and binary forms, with or without
# modification, are permitted provided that the following conditions
# are met:
#
# 1. Redistributions of source code must retain the above copyright
# notice, this list of conditions and the following disclaimer.
#
# 2. Redistributions in binary form must reproduce the above copyright
# notice, this list of conditions, and the following disclaimer in the
# documentation and/or other materials provided with the distribution.
#
# 3. All advertising materials mentioning features or use of this
# software must display the following acknowledgement:
# This product includes software developed at the University of
# Tennessee, Knoxville, Innovative Computing Laboratories.
#
# 4. The name of the University, the name of the Laboratory, or the
# names of its contributors may not be used to endorse or promote
# products derived from this software without specific written
# permission.
#
# -- Disclaimer:
#
# THIS SOFTWARE IS PROVIDED BY THE COPYRIGHT HOLDERS AND CONTRIBUTORS
# ``AS IS'' AND ANY EXPRESS OR IMPLIED WARRANTIES, INCLUDING, BUT NOT
# LIMITED TO, THE IMPLIED WARRANTIES OF MERCHANTABILITY AND FITNESS FOR
# A PARTICULAR PURPOSE ARE DISCLAIMED. IN NO EVENT SHALL THE UNIVERSITY
# OR CONTRIBUTORS BE LIABLE FOR ANY DIRECT, INDIRECT, INCIDENTAL,
# SPECIAL, EXEMPLARY, OR CONSEQUENTIAL DAMAGES (INCLUDING, BUT NOT
# LIMITED TO, PROCUREMENT OF SUBSTITUTE GOODS OR SERVICES; LOSS OF USE,
# DATA OR PROFITS; OR BUSINESS INTERRUPTION) HOWEVER CAUSED AND ON ANY
# THEORY OF LIABILITY, WHETHER IN CONTRACT, STRICT LIABILITY, OR TORT
# (INCLUDING NEGLIGENCE OR OTHERWISE) ARISING IN ANY WAY OUT OF THE USE
# OF THIS SOFTWARE, EVEN IF ADVISED OF THE POSSIBILITY OF SUCH DAMAGE.
# ######################################################################
#
# ----------------------------------------------------------------------
# - shell --------------------------------------------------------------
# ----------------------------------------------------------------------
SHELL = /bin/sh
#
CD = cd
CP = cp
LN_S = ln -s
MKDIR = mkdir
RM = /bin/rm -f
TOUCH = touch
#
# ----------------------------------------------------------------------
# - Platform identifier ------------------------------------------------
# ----------------------------------------------------------------------
#
ARCH = Linux_UNKNOWNSSE2_CBLAS
***ここを変更。これはATLASのmakefileというかarchの値と同じにするみたい。
#
# ----------------------------------------------------------------------
# - HPL Directory Structure / HPL library ------------------------------
# ----------------------------------------------------------------------
#
TOPdir = ***(HPLをインストールしたディレクトリを選択)/hpl
INCdir = $(TOPdir)/include
BINdir = $(TOPdir)/bin/$(ARCH)
LIBdir = $(TOPdir)/lib/$(ARCH)
#
HPLlib = $(LIBdir)/libhpl.a
***なんかこれがなかったような気がする。作ったらできるのかも。

#
# ----------------------------------------------------------------------
# - Message Passing library (MPI) --------------------------------------
# ----------------------------------------------------------------------
# MPinc tells the C compiler where to find the Message Passing library
# header files, MPlib is defined to be the name of the library to be
# used. The variable MPdir is only used for defining MPinc and MPlib.
#
MPdir = (ウチはlam/mpiを使用しているのでlamが入ってるディレクトリ)/lam
MPinc = -I$(MPdir)/include
MPlib = $(MPdir)/lib/libmpi.a ***mpichとかなら変える。
#
# ----------------------------------------------------------------------
# - Linear Algebra library (BLAS or VSIPL) -----------------------------
# ----------------------------------------------------------------------
# LAinc tells the C compiler where to find the Linear Algebra library
# header files, LAlib is defined to be the name of the library to be
# used. The variable LAdir is only used for defining LAinc and LAlib.
#
LAdir = /root/ATLAS/lib/ARCHIVES/Linux_PII
*** ATLASのインストール先。installしてないためここで今日はだめでした、たぶん。

LAinc =
LAlib = $(LAdir)/libcblas.a $(LAdir)/libatlas.a
#
# ----------------------------------------------------------------------
# - F77 / C interface --------------------------------------------------
# ----------------------------------------------------------------------
# You can skip this section if and only if you are not planning to use
# a BLAS library featuring a Fortran 77 interface. Otherwise, it is
# necessary to fill out the F2CDEFS variable with the appropriate
# options. **One and only one** option should be chosen in **each** of
# the 3 following categories:
#
# 1) name space (How C calls a Fortran 77 routine)
#
# -DAdd_ : all lower case and a suffixed underscore (Suns,
# Intel, ...), [default]
# -DNoChange : all lower case (IBM RS6000),
# -DUpCase : all upper case (Cray),
# -DAdd__ : the FORTRAN compiler in use is f2c.
#
# 2) C and Fortran 77 integer mapping
#
# -DF77_INTEGER=int : Fortran 77 INTEGER is a C int, [default]
# -DF77_INTEGER=long : Fortran 77 INTEGER is a C long,
# -DF77_INTEGER=short : Fortran 77 INTEGER is a C short.
#
# 3) Fortran 77 string handling
#
# -DStringSunStyle : The string address is passed at the string loca-
# tion on the stack, and the string length is then
# passed as an F77_INTEGER after all explicit
# stack arguments, [default]
# -DStringStructPtr : The address of a structure is passed by a
# Fortran 77 string, and the structure is of the
# form: struct {char *cp; F77_INTEGER len;},
# -DStringStructVal : A structure is passed by value for each Fortran
# 77 string, and the structure is of the form:
# struct {char *cp; F77_INTEGER len;},
# -DStringCrayStyle : Special option for Cray machines, which uses
# Cray fcd (fortran character descriptor) for
# interoperation.
#
F2CDEFS =
#
#
# ----------------------------------------------------------------------
# - HPL includes / libraries / specifics -------------------------------
# ----------------------------------------------------------------------
#
HPL_INCLUDES = -I$(INCdir) -I$(INCdir)/$(ARCH) $(LAinc) $(MPinc)
HPL_LIBS = $(HPLlib) $(LAlib) $(MPlib)
#
# - Compile time options -----------------------------------------------
#
# -DHPL_COPY_L force the copy of the panel L before bcast;
# -DHPL_CALL_CBLAS call the cblas interface;
# -DHPL_CALL_VSIPL call the vsip library;
# -DHPL_DETAILED_TIMING enable detailed timers;
#
# By default HPL will:
# *) not copy L before broadcast,
# *) call the BLAS Fortran 77 interface,
# *) not display detailed timing information.
#
HPL_OPTS = -DHPL_CALL_CBLAS
#
# ----------------------------------------------------------------------
#
HPL_DEFS = $(F2CDEFS) $(HPL_OPTS) $(HPL_INCLUDES)
#
# ----------------------------------------------------------------------
# - Compilers / linkers - Optimization flags ---------------------------
# ----------------------------------------------------------------------
#
CC = /opt/intel/cc/10.1.015/bin/icc
***iccを入れたのでこれはiccを入れます。PATH通してないので絶対パス。
CCNOOPT = $(HPL_DEFS)
CCFLAGS = $(HPL_DEFS) -fomit-frame-pointer -O3 -funroll-loops
#
# On some platforms, it is necessary to use the Fortran linker to find
# the Fortran internals used in the BLAS library.
#
LINKER = /usr/bin/mpif77
***これはmpiのコンパイラをいれるっぽい。
LINKFLAGS = $(CCFLAGS)
#
ARCHIVER = ar
ARFLAGS = r
RANLIB = echo
#
# ----------------------------------------------------------------------


ひとまずこれだけ。
あとで手直しするんだろうなー。

まあできるわけもなく。

エラーのせとこ

S/libhpl.a /root/ATLAS/lib/Linux_UNKNOWNSSE2/libcblas.a /root/ATLAS/lib/Linux_UNKNOWNSSE2/libatlas.a lam/lib/libmpi.a
f95: /root/ATLAS/lib/Linux_UNKNOWNSSE2/libcblas.a: Permission denied
f95: /root/ATLAS/lib/Linux_UNKNOWNSSE2/libatlas.a: Permission denied
/usr/bin/mpif77: No such file or directory
make[2]: *** [dexe.grd] Error 1
make[2]: Leaving directory `/hpl/testing/ptest/Linux_UNKNOWNSSE2_CBLAS'
make[1]: *** [build_tst] Error 2
make[1]: Leaving directory `hpl'


1つはルートでやればいいね。
んで1つはmpif77がディレクトリじゃないと。
そりゃコマンドですよw


いろいろ直した結果できたっぽい。
ログ残します。

とおもったけどこっちじゃ書き過ぎだな。もう1つつくるか。
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